Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YIPF4Q9BSR8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms