Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms