Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP4Q99569 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms