Protein–RNA interactions for Protein: Q99551

MTERF1, Transcription termination factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF1Q99551 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTERF1Q99551 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms