Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms