Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms