Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK1Q96QP1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms