Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDC1Q96MU7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms