Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms