Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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