Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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SPTSSAQ969W0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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SPTSSAQ969W0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SPTSSAQ969W0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPTSSAQ969W0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPTSSAQ969W0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPTSSAQ969W0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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