Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms