Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms