Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT2Q8N9I0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms