Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C9orf40Q8IXQ3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C9orf40Q8IXQ3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C9orf40Q8IXQ3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C9orf40Q8IXQ3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C9orf40Q8IXQ3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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