Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms