Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms