Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms