Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms