Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms