Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms