Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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