Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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