Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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