Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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