Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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