Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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