Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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