Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PWP1Q13610 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PWP1Q13610 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PWP1Q13610 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PWP1Q13610 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PWP1Q13610 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PWP1Q13610 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PWP1Q13610 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PWP1Q13610 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms