Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3AQ13472 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms