Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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