Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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