Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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