Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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