Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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