Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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NFIAQ12857 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIAQ12857 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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