Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STX4Q12846 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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STX4Q12846 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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STX4Q12846 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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STX4Q12846 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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STX4Q12846 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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STX4Q12846 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
STX4Q12846 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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STX4Q12846 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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STX4Q12846 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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STX4Q12846 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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STX4Q12846 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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STX4Q12846 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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