Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms