Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms