Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms