Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms