Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms