Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms