Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms