Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VBP1P61758 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VBP1P61758 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms