Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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