Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms