Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPTEP56180 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPTEP56180 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms