Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPD52P55327 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TPD52P55327 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TPD52P55327 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TPD52P55327 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TPD52P55327 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TPD52P55327 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPD52P55327 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TPD52P55327 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms