Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms